Wochenprogramme
Datum
Veranstaltung
INHALTE
Übungen
Probleme

bis 12. Mai

R
Repetition Biochemie

Ü 00

bis 12. Mai

R
Repetition Mikrobiologie Bio-III

Ü 0

2. April
V1
Stoffwechsel und Ernährung
Ü XII
4. April
V2
Phototrophe Mikroorganismen
Ü XX
P XX
9. April
V3
Photosyntheseprozesse
Ü XX
P XX
9. & 11. April
V4
C-Autotrophie
Ü XXI
PXXI
16. April
V5
Biochemie der Chemolithotrophie
Ü XXII
P XXII
18. April
V6
Thermodynamik und Energetik von Chemolithotrophen
Ü XXX
P XXX
23. April
V7
Anaerobe Atmung I
Ü XXIII
P XXIII
25. April
V8
Anaerobe Atmung II
Ü XXIII
P XXIII
30. April
V9
Fermentationen
Ü XXIV
P XXIV
30. April
V10
Abbau von Makromolekülen und Schadstoffen
Ü XXV
P XXV
1. Mai
E
Exkursion

(1) Art der Veranstaltung: V Vorlesung, Ü Übung, P Problem, R Repetition, E Exkursion
Die Vorlesungen basieren auf den Inhalten der "Reading Assignments" im Lehrbuch "Brock - Biology of Microorganisms, 9th ed.". Es gibt kein weiteres Skript zur Vorlesung; die Darstellungen im Lehrbuch sind eine gute und hinreichende Grundlage für den Kurs.
 
 
 
 
 
 
Inhalte und "Reading Assignments" für 2. April 2002
 
 
 
 
 
DATUM
 
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ZEIT
ART & TITEL der Veranstaltung (1)
 
READING ASSIGNMENTS & ÜBUNGEN (Ü)
Lehrbuch Kapitel (2)
 
2.4. Dienstag
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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08:15
bis
10:00
 

V 1: Stoffwechsel und Ernährung

  • Mikrobielle Diäten
  • Bioenergetik durch Membranpotentiale
  • Energetik und Elektronentransporte
  • S: Energieumwandlung bei der aeroben Atmung
  • Vielfalt energetischer Lebensweisen
  • S: Grundstoffwechsel
  • Assimilation von N, S, P, Fe
  • Polymere Speicherstoffe und Spurenstoffe
 
F: Warum Mikrobiologie fasziniert
 
Übung XII dient der Repetition von Aspekten aus der Stoffwechsel-Biochemie (3)
 
 
 
 
Ü XII 
 
4.1- 4.15
(1) Art der Veranstaltung: V Vorlesung, Ü Übung, S Selbststudium (die mit "S" bezeichneten Inhalte werden vorausgesetzt; die Studierenden können dazu aber in der Vorlesung oder im Diskussionsforum Fragen stellen), P Problem, D Demonstration, F Film, I Illustration, R Repetition, E Exkursion
(2) Lehrbuch: Madigan M.T., J.M. Martinko and J. Parker: "Brock - Biology of Microorganisms", 9th Edition, (BBOM, International Edition), Prentice Hall, 1999. ISBN: 0-13-085264-3.
(3) Biochemie I (Grundstudium 3. Semester), entsprechende Kapitel aus Biochemistry, 2nd ed., Voet, D. and J.G. Voet, John Wiley & Sons, Inc. New York, 1995. ISBN: 0-471-58651-X.
 
 
 
 
 
Inhalte und "Reading Assignments" für 4. April 2002
 
 
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DATUM
 
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ZEIT
ART & TITEL der Veranstaltung (1)
 
READING ASSIGNMENTS & ÜBUNGEN
Lehrbuch Kapitel (2)
 
4. 4. Donnerstag
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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09:15

bis 10:00
 

V 2: Phototrophe Mikroorganismen

  • Phototrophie vs. Chemotrophie (P XX/1 & 2)
  • Physikalische Konsequenzen der Pigmentdiversität
  • Ökologische Folgen der Pigmentdiversität
  • Phylogenetische Taxonomie der Phototrophen
F: Cadagno
I: Sippewissett, Tambo, Cadagno
 

P

XX

zu Photosynthese

P

XX/1

Wachstumsausbeute

P

XX/2

Stoffwechseltypen

P

XX/3

Photosynthese mit Fe(II+)

 

 Ü XX
 
15.1- 15.4
13.1,13.24 - 13.25, 13.29, 13.31-13.32
(1) Art der Veranstaltung: V Vorlesung, Ü Übung, S Selbststudium (die mit "S" bezeichneten Inhalte werden vorausgesetzt; die Studierenden können dazu aber in der Vorlesung oder im Diskussionsforum Fragen stellen), P Problem, D Demonstration, F Film, I Illustration, R Repetition, E Exkursion
(2) Lehrbuch: Madigan M.T., J.M. Martinko and J. Parker: "Brock - Biology of Microorganisms", 9th Edition, (BBOM, International Edition), Prentice Hall, 1999. ISBN: 0-13-085264-3.
  
 
 
 
 
Inhalte und "Reading Assignments" für 9. und 11. April 2002
 
 
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DATUM
 
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ZEIT
ART & TITEL der Veranstaltung (1)
 
READING ASSIGNMENTS & ÜBUNGEN
Lehrbuch Kapitel (2)
 

9.4. Dienstag

 
 
 

 

08:15
bis 10:00
 

V 3: Photosyntheseprozesse

  • Oxygene vs. anoxygene Photosynthese(n)
  • S: Elektronentransport bei der Photosynthese
  • Evolution und Kombination der Photosysteme
  • S: Licht-getriebene Protonenpumpe bei Archäen
 
 
 
Ü XX
 
15.5-15.6
 
  
14.2
 
 
9.4. Dienstag und
11.4. Donnerstag
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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09:15
bis 10:00
 

V4: C-Autotrophie

  • Wege zur Fixierung von CO2 (PXXI/3 & 4)
  • Fixierungswege und Schlüsselenzyme
  • Bildung von ATP und NAD(P)H
  • S: Calvin Zyklus (P XXI/2/3) und RuMP-Weg (PXXI/2/2)
  • Reduktiver Tricarbonsäurezyklus (PXXI/2/4)
  • Acetyl-CoA-Weg dissimilativ und assimilativ
  • Methanogene, Clostridien, Sulfatreduzierer (PXXI/1/1 & 2)
  • Hydroxypropionat-Weg und Serin-Weg (PXXI/2/1)
  • Anaplerotische Reaktionen
  • Strategien für Wachstum auf C1-Verbindungen
 

P

XXI

zu C-Autotrophie

P

XXI/1/1

Acetyl-CoA-Weg: Prozesse

P

XXI/1/2

Acetyl-CoA-Weg: Enzyme

P

XXI/2/1

C1-Fixierung: Serinweg

P

XXI/2/2

C1-Fixierung: RuMP-Weg

P

XXI/2/3

C1-Fixierung: RuBP-Weg

P

XXI/2/4

C1-Fixierung: Reduktiver TCA-Weg

P

XXI/3

Primärproduzenten

P

XXI/4

CO2-Fixierung durch Phototrophe
 
 
 
Ü XXI
 
15.7- 15.8, Fig.15.43, (4.12), 15.18, 13.5
(1) Art der Veranstaltung: V Vorlesung, Ü Übung, S Selbststudium (die mit "S" bezeichneten Inhalte werden vorausgesetzt; die Studierenden können dazu aber in der Vorlesung oder im Diskussionsforum Fragen stellen), P Problem, D Demonstration, F Film, I Illustration, R Repetition, E Exkursion
(2) Lehrbuch: Madigan M.T., J.M. Martinko and J. Parker: "Brock - Biology of Microorganisms", 9th Edition, (BBOM, International Edition), Prentice Hall, 1999. ISBN: 0-13-085264-3.
 
 
 
 
Inhalte und "Reading Assignments" für 16. und 18. April 2002
 
 
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DATUM
 
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ZEIT
ART & TITEL der Veranstaltung (1)
 
READING ASSIGNMENTS & ÜBUNGEN
Lehrbuch Kapitel (2)
 
 
16.4. Dienstag
 
 
08:15
bis 10:00
 
 
V 5: Biochemie der Chemolithotrophie
  • Exklusive Stoffwechselfähigkeiten von Prokaryoten
  • Spezielle Redoxreaktionen (P XXII/1)
  • Oxidation von anorganischen Elektronendonatoren (P XXII/2)
  • H2, reduzierte Schwefelverbindungen, Ferro-Eisen-Oxidation, Nitrifikation (P XXII/4 & 5)
  • Disproportionierung (P XXII/7)
  • Methanotrophie, Methylotrophie
  • C-Assimilation bei Chemolithotrophen
     
I: Sulfidotrophe: Beggiatoa sp. am Seegrund, Thioploca sp. und Thiomargarita sp.
F: Ferrotrophe: Rosten der Titanic, Eisenbergwerk Gonzen (Exkursion)
 
 

P

XXII

zu Chemolithotrophie

P

XXII/1

Autotrophe Vielfalt

P

XXII/2

Schwefeloxidation

P

XXII/3

Anaerobe Ammoniumoxidation

P

XXII/4

Aerobe Ammoniumoxidation

P

XXII/5

Neutrophile Eisen(II)-Oxidierer

P

XXII/6

Acidophile Eisen(II)-Oxidierer

P

XXII/7

Thiosulfatdisproportionierung
 

 

Ü XXII  
 
15.9-15.14, 13.2-13.5, 14.7-14.9, 16.12
 
 
18.4. Donnerstag
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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09:15
 
 
V 6: Thermodynamik und Energetik von Chemolithotrophen
  • S: Grundlagen der biologischen Thermodynamik
  • Acidophile und alkaliphile Chemolithotrophe (P XXII/6)
  • Thermophile Chemolithotrophe
  • Aerobe vs. anaerobe Chemolithotrophie (P XXII/3)
 
D: P XXX Thermodyn©
Übungen am Computer. Thermodyn verlangt Zugangsberechtigung. Sie erhalten Login und Passwort per E-Mail, wenn Ihre Anfrage an prokaryo@botinst.unizh.ch Name, Vorname und Leginummer enthält.
 

P

XXX

zu Thermodynamik, Energetik - Übungen mit Thermodyn©

P

XXX/1

Anaerober Benzoatabbau

P

XXX/2

Einfluss von Acetat auf Benzoatabbau

P

XXX/3

Weitere Anwendungen der Bio-Thermodynamik

ANMELDUNG FÜR EXKURSION
 
 
 
Ü XXX  
 
16.18, 5.10 (S. 404)
(1) Art der Veranstaltung: V Vorlesung, Ü Übung, S Selbststudium (die mit "S" bezeichneten Inhalte werden vorausgesetzt; die Studierenden können dazu aber in der Vorlesung oder im Diskussionsforum Fragen stellen), P Problem, D Demonstration, F Film, I Illustration, R Repetition, E Exkursion
(2) Lehrbuch: Madigan M.T., J.M. Martinko and J. Parker: "Brock - Biology of Microorganisms", 9th Edition, (BBOM, International Edition), Prentice Hall, 1999. ISBN: 0-13-085264-3.
 
 
 
 
 
 
 
Inhalte und "Reading Assignments" für 23. und 25. April 2002
 
 
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DATUM
 
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ZEIT
ART & TITEL der Veranstaltung (1)
 
READING ASSIGNMENTS & ÜBUNGEN
Lehrbuch Kapitel (2)
 
 
23.4. Dienstag
 
 
08:15
bis 10:15
 
 
V 7: Anaerobe Atmung I
  • S: Rolle von Sauerstoff im Stoffwechsel
  • S: Energetik mit alternativen Elektronenakzeptoren
  • Elektronen- und Protonentransporte (P XXIII/5)
  • Denitrifikation, Nitrat-Reduktion (P XXIII/3)
 
 

 

Ü XXIII
 
15.15-15.16, 16.16
 
 
25.4. Donnerstag
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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09:15
 
 
V 8: Anaerobe Atmung II
  • Sulfat- und Schwefelreduktion (P XXIII/1/1 & 2)
  • CO2-Reduktion: Acetogenese und Methanogenese
  • Ferri-Eisen und Mangan als Elektronenakzeptoren (P XXIII/4)
  • Metalle in Oxyanionen als Elektronenakzeptoren
  • DMSO und TMNO als Elektronenakzeptoren
  • Organische Verbindungen (Fumarat) und halogenierte Organika als Elektronenakzeptoren (P XXIII/2)
 

P

XXIII

zur Anaeroben Atmung

P

XXIII/1/1

Sulfatatmung mit Propionatabbau

P

XXIII/1/2

Sulfatatmung vollständig vs. unvollständig

P

XXIII/2

Schwefelatmung und Fumaratatmung

P

XXIII/3

Denitrifikation

P

XXIII/4

Eisen(III)-Reduktion

P

XXIII/5

Funktion von Chinon-[H]-Membranpumpen
 
 
 
Ü XXIII
 
15.17-15.20, 13.17, 14.3, 14.6
16.17-16.18, 16.22,
 
 
 
 
(1) Art der Veranstaltung: V Vorlesung, Ü Übung, S Selbststudium (die mit "S" bezeichneten Inhalte werden vorausgesetzt; die Studierenden können dazu aber in der Vorlesung oder im Diskussionsforum Fragen stellen), P Problem, D Demonstration, F Film, I Illustration, R Repetition, E Exkursion
(2) Lehrbuch: Madigan M.T., J.M. Martinko and J. Parker: "Brock - Biology of Microorganisms", 9th Edition, (BBOM, International Edition), Prentice Hall, 1999. ISBN: 0-13-085264-3.
 
 
 
 
 
Inhalte und "Reading Assignments" für 30. April 2002
 
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DATUM
 

ZEIT
ART & TITEL der Veranstaltung (1)
 
READING ASSIGNMENTS & ÜBUNGEN
Lehrbuch Kapitel (2)
 
30.4. Dienstag
 
08:15
bis 09:00
 
 
V 9: Fermentationen
  • Energiestoffwechsel in Anaeroben
  • Dissimilation von Kohlehydraten (P XXIV/1/1 & 2)
  • Dissimilation von Aminosäuren (P XXIV/3)
  • Dissimilation von N-Heterozyklen (P XXV/2-5)
  • Organische Verbindungen als Elektronensenken (P XXIV/2/1 & 2, P XXV/6)
  • Quantifizierung von Fermentationen (P XXIV/4)
  • Schlüsselenzyme und Schlüsselmetaboliten (P XXIV/7)
  • Methanogenese von Acetat und Methanol (P XXIV/6)
  • Assimilation von C2-Verbindungen: Glyoxylatweg
 

P

XXIV

zu Fermentationen

P

XXIV/1/1

Homoacetatgärung: C. thermoaceticum

P

XXIV/1/2

Säuregärung durch Clostridium sp.

P

XXIV/2/1

Propionatstoffwechsel: Acrylyl~CoA-Weg

P

XXIV/2/2

Propionatstoffwechsel: Succinyl-Propionyl~CoA-Weg

P

XXIV/3

Stickland-Reaktion

P

XXIV/4

Fermentationsbilanzen

P

XXIV/5

Anaerobe Abbaunetze

P

XXIV/6

Acetyl~CoA-Weg bei Methanogenen

P

XXIV/7

Enzyme des THF-Weges

P

XXIV/8

Mutualistische Stoffwechselleistungen
 
 
 
Ü XXIV  
 
15.21-15.23, 13.10, 13.18, 13.21, 16.14
16.15
 
30.4. Dienstag
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
To top
 
09:15
bis 10:00
 
 
V 10: Abbau von Makromolekülen und Schadstoffen
  • Stoffwechselsyntrophien (P XXIV/8)
  • Vielfalt der Gärungsprozesse (P XXIV/5)
  • Kohlenhydrate, Lipide, Proteine, Nukleinsäuren
  • Aromaten, incl. aromatische Kohlenwasserstoffe (P XXV/1)
  • Aliphatische und aromatische Kohlenwasserstoffe
  • Organische Schadstoffe
  • Problemsubstrate für Anaerobier (P XXV/7/1 & 2)
 

P

XXV

zu Abbau von Schadstoffen

P

XXV/1

Anaerober Toluolabbau

P

XXV/2

Atrazinabbau

P

XXV/3

Umbau von Nitroaromaten

P

XXV/4

Abbau von Nitroaromaten

P

XXV/5

p-Nitrophenol-Abbau

P

XXV/6

Halorespiration

P

XXV/7/1

Vinylchlorid Oxidation

P

XXV/7/2

Vinylchlorid Dehalogenase
  
 
 
Ü XXV
 
15.24-15.28, 16.20-16.22
(1) Art der Veranstaltung: V Vorlesung, Ü Übung, S Selbststudium (die mit "S" bezeichneten Inhalte werden vorausgesetzt; die Studierenden können dazu aber in der Vorlesung oder im Diskussionsforum Fragen stellen), P Präsentation durch Studierende, D Demonstration, F Film, I Illustration, R Repetition, E Exkursion
(2) Lehrbuch: Madigan M.T., J.M. Martinko and J. Parker: "Brock - Biology of Microorganisms", 9th Edition, (BBOM, International Edition), Prentice Hall, 1999. ISBN: 0-13-085264-3.